|星空彩票电脑版 %A 周抒阳, 付旭阳, 孙瑶, 吴炜, 赵书冉, 刘硕, 郝肖琼, 石瑞丽 %T 基于GEO 数据库的趋化因子在缺血性脑卒中作用机制研究 %0 Journal Article %D 2022 %J 神经药理学报 %R 10.3969/j.issn.2095-1396.2022.06.001 %P 1-7 %V 12 %N 6 %U {http://actanp.hebeinu.edu.cn/CN/abstract/article_823.shtml} %8 2022-12-26 %X
目的:应用生物信息学方法分析治疗缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的作用机制。方法:通过GEO 数据库获得治疗IS 的潜在靶点,应用基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书 (kyoto gene and genome encyclopedia,KEGG)信号通路富集分析获得靶点参与的信号通路、生物过程、分子功 能,通过STRING 在线数据库构建分析蛋白质之间的相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)网络, 导入Cytoscape 软件并构建网络,CytoHubba 插件筛选出关键靶点。结果:通过数据库筛选获得差异基因156 个,其中133 个基因上调、23 个基因下调,KEGG 富集通路分析筛选出靶点参与趋化因子信号通路、NF-κB 信 号通路等37 条信号通路,GO 功能富集分析结果表明靶点参与了细胞对脂多糖的反应、白细胞趋化性等多个生 物过程。最终确定关键靶点为趋化因子CXC 配体8(C-X-C motif chemokine 8,CXCL8)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、CXCL2、白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)、CXCL1、IL-1β、CC 型趋化因子配体4(C-C motif chemokine 4,CCL4)、IL-1α、细胞间黏附分子1(intercellular adhesion molecule 1,ICAM1)、前列腺素G/H 合酶2(prostaglandin G/H synthase 2,PTGS2),关键通路为趋化因子信号通路。结论:所筛选的关键基因可能成 为诊断IS 的标志物或潜在治疗靶点,并为该病的发病机制研究提供了新的理论依据。
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